虚拟筛选(Virtual Screening,VS)是利用小分子数据库进行活性化合物筛选的有效工具。通过计算小分子化合物与药物靶标之间的分子对接,虚拟筛选可以迅速从数十至数百万个化合物中甄选出具有良好成药性的活性化合物。这非常有效地减少了实验筛选的化合物数量,缩短了研究周期,同时降低了药物研发的成本。据悉,虚拟筛选的阳性率在5%到30%之间,成功辅助药物设计的案例逐年增多,使得虚拟筛选成为了当前最具潜力的药物开发工具之一。
尊龙凯时的虚拟筛选技术利用小分子与药物靶标的对接运算,能够快速从庞大的分子库中筛选成药性活性化合物,大幅度降低实验筛选的化合物数量。该过程不仅周期短、成本低,而且阳性率高。
虚拟筛选的方法分类
虚拟筛选的方法主要分为基于受体生物大分子结构的虚拟筛选(structure-based virtual screening, SBVS)和基于配体小分子的虚拟筛选(ligand-based virtual screening, LBVS)两类。其中,基于受体的虚拟筛选是根据实验测定的或同源模建的受体生物大分子的三维结构,通过分子对接技术确定小分子与受体的结合构象,并利用结合能评分函数评价小分子与受体的结合能力,从而从大量化合物中筛选出合理的结合模式和高预测得分的化合物,供后续生物活性测试使用。而基于配体的虚拟筛选则利用现有药物的结构及活性关系分析,建立定量构效关系或药效团模型,以预测新化合物的活性。
虚拟筛选的关键因素
进行虚拟药物筛选的关键在于准确测定或预测靶标蛋白质的分子结构,以及快速精确地计算候选化合物与靶标之间的自由能变化。这两项技术是制约虚拟筛选准确性的重大瓶颈。
虚拟筛选的项目报告
一般来说,虚拟筛选会提供每个筛选化合物库中排名前200的化合物结构式及其相关信息(包含三个文件:SDF、PDF、EXCEL),并展示综合排名前5名化合物与靶蛋白的对接模式图(包括2D和3D图),以及包含靶蛋白背景调研、筛选流程、优势化合物对接模式分析等内容的PDF项目报告。
尊龙凯时的优势
尊龙凯时凭借丰富的数据库资源以及高性能的计算机服务器,提供专业的分子对接和虚拟筛选服务。经过优化的虚拟筛选方案能够大规模减少需要实验筛选的化合物数量,增加理想先导物发现的可能性,并且缩短虚拟筛选服务时间,降低后期先导物优化失败的风险。客户可根据具体需求定制高性价比的服务方案,以便为科研客户提供优质的早期药物研发服务。
服务内容
尊龙凯时为拥有虚拟药物筛选需求的客户提供全方位的服务,客户只需提供靶标相关的生物学信息,便可获得最佳的活性化合物筛选结果,为进一步生物活性评价奠定基础。服务内容包括:
- 靶点调研
- 模型构建
- 小分子化合物库制备
- 分子对接筛选/药效团建模及筛选
- 人工挑选
- 理想实体化合物的组库服务
我们团队拥有高性能的计算机服务器、丰富的数据库资源(包括1600万以上的可购买化合物)、专业的分子模拟与药物设计背景,以及高度标准的数据隐私管理。同时,我们还提供具有竞争力的价格优势,助力客户实现快速有效的药物研发目标。